2022/12 15

[유기화학] 1-12. 화학 구조 그리기 (Drawing chemical structures)

축소 구조식(condensed structures): 탄소-수소 및 탄소-탄소 단일 결합은 나타내지 않음. ex. 탄소에 세 개의 수소가 결합되어 있으면 CH3이라고 나타냄. (3은 아래 첨자) 탄소 사이의 수평 방향 결합은 나타내지 않으나, 수직 방향 결합은 나타낸다. 또는, 묶어서 나타내기도 한다. (ex. 2-methylbutane) 골격 구조식(skeletal structure) 규칙 1. 탄소 원자는 흔히 나타내지 않는다. 대신 탄소 원자는 두 개의 선(결합)의 교차 지점과 각 선의 끝에 있다고 가정한다. 가끔 강조하거나 명확하게 하기 위해 탄소 원자를 표시하기도 한다. 2. 탄소에 결합된 수소는 그리지 않는다. 탄소는 항상 4가를 가지므로 각각의 탄소에 맞는 숫자의 수소를 마음 속에 그려 넣는..

[유기화학] 1-11. 화학 결합의 설명: 분자 궤도함수 이론 (Describing chemical bonds: molecular orbital theory)

분자 궤도함수(MO) 이론 (Molecular orbital (MO) theory) 공유 결합의 형성: 서로 다른 원자들에 있는 원자 궤도함수(파동 함수)들이 수학적으로 조합되어 분자 궤도함수(molecular orbital)를 형성함. 오비탈이 개별적인 원자에 속하기 보다는 분자 전체에 속하기 때문에 분자 오비탈이라고 함. 오비탈 조합이 일어나는 방법 두 가지 부가 조합(Additive combination): 에너지가 낮고 계란 모양을 한 분자 오비탈. 1s 원자 오비탈보다 에너지가 더 낮다 → 결합성 MO (bonding MO) 상쇄 조합(Subtractive combination): 두 핵 간에 하나의 마디(node)를 갖고 에너지가 높은 분자 오비탈. 1s 원자 오비탈보다 에너지가 더 높다 → ..

[유기화학] 1-10. 질소, 산소, 인 및 황의 혼성화 (Hybridization of nitrogen, oxygen, phosphorus, and sulfur)

질소: 고립 전자쌍을 하나 가지고 있어 최대 3개의 결합을 할 수 있음. ex. methylamine (CH3NH2): 네 개의 sp3 오비탈이 혼성화되어 있고, 이 중 한 오비탈에 고립 전자쌍이 들어가 있음. 산소: 고립 전자쌍을 두 개 가지고 있어 최대 2개의 결합을 할 수 있음. ex. methanol (CH3OH): 4개의 sp3 오비탈 중 두 개는 비결합성 고립 전자쌍이 들어가 있고, 나머지 두 오비탈이 결합 형성에 사용됨. 인, 황: 질소와 산소의 3주기 유사체. 하지만 외각 껍질의 팔전자계를 확장시킬 수 있어 전형적인 공유 결합 수보다 더 많은 결합을 형성할 수 있음. ex. methyl phosphate (CH3OPO3): 인이 산소 네 개와 결합하고 있으며, 그 중 한 산소와는 이중 결합..

[유기화학] 1-9. sp 혼성 궤도함수와 acetylene의 구조 (sp Hybrid orbitals and the structure of acetylene)

sp 혼성(sp hybrid): 한 개의 s 오비탈과 한 개의 p 오비탈이 혼성화한 오비탈. 두 개의 혼성 오비탈이 생기고, 두 개의 p 오비탈은 혼성화되지 않고 남아 있음. 두 sp 오비탈은 x축에서 서로 180도 떨어져서 놓여 있고, 남아 있는 두 p 오비탈들은 y축, z축 상에 수직. 탄소 간 삼중 결합의 형성 sp 혼성 오비탈이 정면으로 겹쳐져 강한 sp-sp 시그마 결합을 형성. 동시에 각 탄소의 py, pz 오비탈도 각각 측면으로 겹쳐져 py-py 파이 결합, pz-pz 파이 결합을 형성함. 이렇게 총 6 개의 전자를 공유하며 삼중 결합을 형성함. Methane, ethane, ethylene 및 acetylene에서 C-C 결합과 C-H 결합의 비교 Problem 1-13. Draw a li..

[유기화학] 1-8. sp2 혼성 궤도함수와 ethylene의 구조 (sp2 Hybrid orbitals and the structure of Ethylene)

단일 결합(single bond): 결합한 원자들 사이에 한 개의 전자쌍을 공유한 결합. 이중 결합(double bond): 결합한 원자들 사이에 두 개의 전자쌍을 공유한 결합. 삼중 결합(triple bond): 결합한 원자들 사이에 세 개의 전자쌍을 공유한 결합. sp2 혼성 오비탈(sp2 hybrid orbital): 한 개의 s 오비탈과 두 개의 p 오비탈이 혼성화하여 만들어진 오비탈. 탄소의 경우, sp2 혼성 오비탈을 만들면 혼성화되지 않은 p 오비탈 하나가 남음. 세 개의 sp2 혼성 오비탈은 서로의 결합각이 120도가 되도록 한 평면에 놓여 있고, 남아 있는 p 오비탈은 sp2 혼성 오비탈의 평면에 수직으로 배열됨. sp2 오비탈이 형성된 두 개의 탄소가 서로 접근하면 이들은 sp2-sp2..

[유기화학] 1-7. sp3 혼성 궤도함수와 ethane의 구조 (sp3 Hybrid orbitals and the structure of ethane)

Ethane: 탄소 두 개가 C-C 결합을 하고 있고, 각 탄소는 세 개의 수소와 결합을 하고 있는 분자. 각 탄소에 있는 한 개씩의 sp3 혼성 오비탈은 서로 시그마 겹침으로 두 탄소가 결합함. 각 탄소에 남은 세 개의 sp3 혼성 오비탈은 수소의 1s 오비탈과 겹쳐져 여섯 개의 C-H 결합을 형성함. Problem 1-8. Draw a line-bond structure for propane, CH3CH2CH3. Predict the value of each bond angle, and indicate the overall shape of the molecule. Answer. propane bond angle ∠CCC=112∘ ∠HCH=107∘ ∠CCH≈109∘ Problem 1-9. Convert..

[유기화학] 1-6. sp3 혼성 궤도함수와 methane의 구조 (sp3 Hybrid orbitals and the structure of methane)

Methane: 탄소 하나가 수소 네 개와 결합한 분자. 탄소의 원자가 전자는 2s2 2p2로 2s와 2p 두 종류의 오비탈을 가짐. → 두 종류의 C-H 결합이 있을 것이라고 추측할 수 있음(s-s, p-s). 하지만 실제로는 methane의 모든 C-H 결합이 동등함. ⇒ sp3 혼성(sp3 hybrid)으로 존재하기 때문. sp3 혼성 궤도함수(sp3 hybrid orbital): s 오비탈 1개와 p 오비탈 3개가 혼성화(hybridize)되어 공간적으로 정사면체로 배열된 새로운 오비탈. 두 개의 로브를 가지고 있음. 핵에 대해 비대칭적이며 방향성을 가지고 있음. 다른 원자와 오비탈이 겹치면 강한 결합을 형성함. sp3 orbital 비대칭성의 이유: p 오비탈의 로브가 +, - 두 가지 기호를 ..

[유기화학] 1-5. 화학 결합의 설명: 원자가 결합 이론 (Describing chemical bonds: Valence bond theory)

원자가 결합 이론(Valence bond theory) 원자 사이의 전자 공유, 즉 공유 결합은 어떻게 형성되는가에 대한 모형. 두 원자가 서로 접근하여 한 원자에 전자 한 개가 들어 있는 궤도함수와 다른 원자의 전자 한 개가 들어 있는 궤도함수가 서로 겹쳐질 때(overlap)에 공유 결합이 형성된다. 겹쳐진 궤도함수 안에서 지금 짝을 이룬 전자들은 양쪽 원자 핵에 의해 서로 끌리게 되고, 따라서 두 원자는 서로 결합한다. ex. H2 분자에서 H-H 결합은 전자 한 개씩이 채워져 있는 두 수소의 1s 오비탈이 서로 겹쳐져서 형성된 것임. 시그마 결합(sigma bond, σ): 두 개의 원자 오비탈이 정면 겹침(head-on overlapping)에 의해 형성된 결합. 원통형 대칭(cylindrica..

[유기화학] 1-4. 화학 결합 이론의 발전 (Development of chemical bonding theory)

고립된 상태의 원자들은 더 안정한(에너지가 더 낮은) 상태의 화합물이 되기 위해 서로 결합함. 보통, 화학 결합이 형성될 때 에너지는 대부분 열의 형태로 화학계(chemical system)으로부터 밖으로 방출되어 낮은 에너지 상태가 됨. 반대로 화학 결합이 끊어질 때는 에너지가 흡수되어 높은 에너지 상태가 됨. 원자가 껍질(valence shell): 전자 껍질 중 가장 바깥에 존재하는(에너지 상태가 가장 높은) 최외각 전자 껍질. 원자가 전자(valence electron): 원자가 껍질에 존재하는 전자. 옥텟 규칙(octet rule) 원자가 껍질에 여덟 개의 전자가 존재해야 가장 안정하다는 규칙. 주로 2주기 원소에 성립. 보편적으로 적용하면, 원소가 주기율표상 가까이 위치한 비활성 기체(nobl..

[유기화학] 1-3. 원자 구조: 전자 배치 (Atomic structure: Electron Configurations)

바닥 상태 전자 배치(ground-state elctronic configuration): 어떤 원자의 가장 안정한 전자 배치. 가장 낮은 에너지 배열. 전자 배치 규칙 1. 쌓음 원리(Aufbau principle): 가장 낮은 에너지 오비탈부터 먼저 채운다. ex. 1s → 2s → 2p → 3s → 3p → 4s → 3d (주의! 4s가 3d보다 낮다.) 2. 파울리의 배타 원리(Pauli exclusion principle): 한 오비탈에는 두 개의 전자만을 채울 수 있고, 이들은 반대 스핀을 가져야 함. (up and down) 3. 훈트 규칙(Hund’s rule): 에너지 상태가 같은 오비탈에 전자가 채워질 때는 최대한 홀전자 수가 많게 배치되며, 서로 같은 스핀을 가지도록 한다. ex. 탄..

[유기화학] 1-2. 원자 구조: 궤도함수 (Atomic structure: Orbitals)

궤도함수/오비탈(orbital) 원자 내 전자의 분포 상태, 또는 분포 상태를 기술하는 파동 함수의 해. 원자 내 전자가 어떻게 분포되어 있는가에 대한 함수. Ψ (psi)로 표기. 삼차원 공간에 Ψ 제곱을 도시하면 궤도함수는 하나의 전자가 가장 가능성이 높게 차지할 것 같은 핵 주위의 공간의 부피를 나타냄. → 전자구름 형태로, 전자가 대부분의 시간을 머무르게 되는 (90~95%) 공간을 나타냄. 오비탈의 형태 (s, p, d orbital) 전자 껍질(electron shell): 전자가 핵 주위를 돌면서 만드는 궤도. 한 원자의 궤도들은 순차적으로 보다 큰 크기와 에너지를 가지는 각각의 전자 껍질들로 구성된다. 각각의 전자 껍질은 다른 수와 종류의 궤도함수를 가지며, 하나의 전자 껍질 안에 있는 각..

[유기화학] 1-1. 원자 구조: 핵 (Atomic structure: The nucleus)

원자(atom): 물질을 이루고 있는 기본 구성 단위. 원자 구조 = 핵 + 전자(electrons) 핵(nucleus): 양성자(protons) + 중성자(neutrons) 원자 번호(atomic number, Z): 원자 속의 양성자 수 질량수(mass number, A): 양성자와 중성자의 합 주어진 원소의 모든 원자들은 동일한 원자 번호를 갖지만, 중성자 수에 따라 각각 다른 질량수를 가질 수 있다. ⇒ 동위원소 동위원소(isotope): 원자 번호가 동일하지만 질량수가 다른 원자 ex. 탄소의 원자 번호는 6이다. 중성자가 6개인 탄소는 질량수가 12이며, 중성자가 7개인 탄소는 질량수가 13이다. 원자 질량/원자량(atomic mass/atomic weight): 어떤 한 원소의 자연에 존재하..

버치왈드-하트윅 교차 커플링 (Buchwald-Hartwig cross-coupling) 반응 매커니즘

안녕하세요, 라브입니다. 오늘은 버치왈드-하트윅 커플링 반응 (Buchwald-Hartwig cross-coupling)에 대해 알아보도록 하겠습니다. Buchwald-Hartwig cross-coupling은 팔라듐 촉매를 이용한 반응 중 비교적 최근에 개발된 반응으로, C-N bond를 형성하는 반응입니다. 해당 반응은 aryl halide와 primary or secondary amine의 반응으로 aryl amine을 형성합니다. 기존에는 aryl group에 직접적으로 amine을 도입하기는 매우 어려웠는데, 이를 가능하게 했다는 점에서 큰 유용성을 갖습니다. 버치왈드-하트윅 커플링의 반응 매커니즘입니다. 팔라듐 0가 촉매와 aryl halide가 oxidative addition을 통해 com..

소노가시라 교차 커플링 (Sonogashira cross-coupling) 반응 매커니즘

안녕하세요, 라브입니다. 이번 글에서는 소노가시라 커플링 (Sonogashira cross-coupling)에 대해 알아보겠습니다. Sonogashira coupling은 organohalide와 terminal alkyne을 이용하여 C-C bond formation을 이루는 반응입니다. 팔라듐 촉매와 조촉매로써 구리(Cu)를 사용한다는 특징이 있으며, 염기(base)의 사용이 필수적입니다. 소노가시라 커플링의 촉매 사이클은 위와 같이 크게 팔라듐 사이클, 구리 사이클 두 가지로 이루어집니다. 먼저 팔라듐 촉매에 의한 반응 사이클을 보시면 그동안 봐왔던 촉매 사이클을 그대로 따릅니다. 활성화된 팔라듐 촉매(A)와 organohalide가 oxidative addition (OA)하여 coordinati..

쿠마다 커플링 (Kumada cross-coupling) 반응 매커니즘

안녕하세요, 라브입니다. 이번 글에서는 쿠마다 커플링 (Kumada cross-coupling)에 대해 알아보도록 하겠습니다. Kumada coupling은 organohalide와 그리냐드 시약(Grignard reagent)인 organomagnesium를 이용하여 C-C bond formation된 product를 합성하는 반응입니다. 촉매로는 팔라듐 또는 니켈을 이용할 수 있습니다. 쿠마다 커플링의 매커니즘은 위와 같습니다. 기본적인 전이 금속 촉매 사이클과 같이 활성화된 팔라듐 촉매와 organohalide가 oxidative addition을 통해 알킬 그룹이 coordination을 이루고, grignard reagent인 organomagnesium으로부터 transmetalation을 통..